几乎gromacs的所有分析数据都可以输出为xmgrace的数据文件,g_traj可以产生gromacs轨迹的各个组的坐标,速度,受力和边界等等。使用” -com “参数可以求出轨迹中各个组的质心的坐标,速度,受力等;使用” -mol “则可以求取系统中各个分子的信息;” -ot “则可以求出系统中各个组的温度。
还有几个其他参数,比如” -cv “可以求平均速度,” -cf “可以求平均受力等。其他参数同其他命令无异,参加说明文件。
由 sen 发表于 December 15, 2007 04:53 PM