September 29, 2005

细胞生物学(附录参考书)

1. Bruce Alberts et al. Molecular Biology of the Cell 4th. Garland Science, 2002.

2. Harvey Lodish et al. Molecular Cell Biology 4th. W. H. Freeman and Company, 1999.

3. Gerald Karp. Cell and Molecular Biology: Concepts and Experiments 3rd. Wiley & Sons, 2002.

4. 韩贻仁. 分子细胞生物学科学出版社. 2001年03月.

5. 印莉萍, 刘祥林. 分子细胞生物学实验技术. 首都师范大学出版社.2001年01月.

6. 牛富文. 医用分子细胞生物学. 河南医科大学出版社.1997年06月.

7. 罗深秋. 医用细胞生物学.军事医学科学出版社. 1998年08月.

8. 陈诗书. 医学细胞与分子生物学. 上海医科大学出版社. 1999年01月.

9. 周建明. 医学细胞与分子生物学. 上海医科大学出版社.1997年06月.

10. 高文和. 医学细胞生物学. 天津大学出版社.2000年09月.

11. 左及. 医学细胞生物学. 上海医科大学出版社.1999年06月.

12. 余从年. 医学细胞生物学导论. 科学出版社. 2000年07月.

13. 郭葆玉. 细胞分子生物学实验操作指南. 安徽科学技术出版社1998年04月.

14. 王德耀. 细胞生物学. 上海科学技术出版社.1998年.

15. 翟中和. 细胞生物学. 高等教育出版社.1995年1月.

16. 翟中和. 细胞生物学.高等教育出版社.2000年8月.

17. 汪堃仁. 细胞生物学(第二版). 北京师范大学出版社.1998年11月.

18. 郑国锠. 细胞生物学(第二版). 高等教育出版社.1992年04月.

19. 翟中和. 细胞生物学动态-第一卷. 北京师范大学出版社.1997年03月.

20. 翟中和. 细胞生物学动态. 第二卷. 北京师范大学出版社.1998年10月.

21. 翟中和. 细胞生物学动态-第三卷. 北京师范大学出版社1.999年.

22. 辛华. 细胞生物学实验.科学出版社. 2001年02月.

23. 刘鼎新. 细胞生物学研究方法与技术(第二版). 北医、协和医大联合出版社.1997年05月.

24. 杨汉民. 细胞生物学实验(第二版). 高等教育出版社.1997年07月.

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细胞生物学(对未来的希望)

人类经历了漫长的采猎文明后,约在一万年前进入农业经济时代,18世纪60年代,英国率先进入工业经济,20世纪50美国最早走完工业经济的历程,进入信息时代。据专家估计这一经济形态的“寿命”为75~80年,到本世纪20年代将渐渐失去活力,届时人类迎接下一个经济时代,即生物经济时代的到来,生物经济的资源为基因,其核心技术为建立在细胞与分子生物学理论基础上的各类生物技术。

生物经济时代特点是:

1. 基因克隆和重组技术日趋成熟,人类将根据经济需要去开发和操纵遗传资源,如通过转基因的方法生产人类生长素、干扰素(每千克价值440亿美元)等昂贵的药物;培育具有特殊功能的转基因动植物,如具有苏云金毒素的抗虫棉。在商业目的的驱使下,大量的改造物种,开始了偏离自然进化规律的二次“创世纪”,由此所产生的基因污染和伦理问题将越来越突出。

2. 人类基因组[4]大约10万个基因的作图和测序完成,进入以揭示基因功能为主的后基因组计划,人类遗传病的基因治疗成为常规技术。

3. 动物克隆技术和人类干细胞定向分化技术取得突破,人工创建的组织,器官将用于医学治疗的目的。

4. 神经生物学、信息生物学、细胞生物学等学科的发展,为实现人工智能奠定了理论基础。

5. 基因武器可能成为继核武器以后又一种足以令人类毁灭的武器。

6. 生物芯片[5](图1-4)技术广泛应用于科研、医疗、农业、食品、环境保护、司法鉴定等领域。成为与晶体管芯片一样重要的产业。

7. 植物光合作用机理研究取得重大突破,人工光解水产生的氢气成为及化石燃料之后主要的能源。

8. 计算机和网络系统为生物经济的遗传信息管理和交流提供了方便。

DNAchips.jpg
图1-4 DNA芯片(图片来自http://www.ornl.gov)

[4]人类基因组计划(Human genome project)由美国于1987年启动,我国于1993年加入该计划,承担其中1%的任务,即人类3号染色体短臂上约30Mb的测序任务。2000年6 月28日人类基因组工作草图完成。由于人类基因测序和基因专利可能会带来巨大的商业价值,各国政府和一些企业都在积极地投入该项研究,如1997年 AMGE公司转让了一个与中枢神经疾病有关的基因而获利3.92亿美元。

[5]生物芯片技术是通过缩微技术,根据分子间特异性地相互作用的原理,将生命科学领域中不连续的分析过程集成于硅芯片或玻璃芯片表面的微型生物化学分析系统,以实现对细胞、蛋白质、基因及其它生物组分的准确、快速、大信息量的检测。按照芯片上固化的生物材料的不同,可以将生物芯片划分为基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片和组织芯片。目前,最成功的生物芯片形式是以基因序列为分析对象的“微阵列(microarray)”,也被称为基因芯片(Gene chip)或DNA芯片(DNA chip)。1998年6月美国宣布正式启动基因芯片计划,联合私人投资机构投入了20亿美元以上的研究经费。世界各国也开始加大投入,以基因芯片为核心的相关产业正在全球崛起,目前美国已有8家生物芯片公司股票上市,平均每年股票上涨75%,据统计全球目前生物芯片工业产值为10亿美元左右,预计今后5 年之内,生物芯片的市场销售可达到200亿美元以上。

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细胞生物学(学习方法)

第一、认识细胞生物学课程的重要性,正如原子是物理性质的最小单位,分子是化学性质的最小单位,细胞是生命的基本单位。50年代以来诺贝尔生理与医学奖大都授予了从事细胞生物学研究的科学家,可见细胞生物学的重要性。如果你将来打算从事生物学相关的工作,学好细胞生物学能加深你对生命的理解。

第二、明确细胞生物学的研究内容,即:结构、功能、生活史。生物的结构与功能是相适应的,每一种结构都有特定的功能,每一种功能的实现都需要特定的物质基础。如肌肉可以收缩、那么动力是谁提供的、能量从何而来的?

第三、从显微、超微和分子三个层次来认识细胞的结构与功能。一方面每一个层次的结构都有特定的功能,另一方面各层次之间是有机地联系在一起的。

第四、将所学过的知识关联起来,多问自己几个为什么。细胞生物学涉及分子生物学、生物化学、遗传学、生理学等几乎所有生物系学过的课程,将学过的知识与细胞生物学课程中讲到的内容关联起来,比较一下有什么不同,有什么相同,为什么?尽可能形成对细胞和生命的完整印象,不要只见树木不见森林。另一方面细胞生物学各章节之间的内容是相互关联的,如我们在学习线粒体与叶绿体的时候,要联想起细胞物质运输章节中学过的DNP、FCCP等质子载体对线粒体会有什么影响,学习微管结构时要问问为什么β微管蛋白是一种G蛋白,而α微管蛋白不是,学习细胞分裂时要想想细胞骨架在细胞分裂中起什么作用,诸如此类的例子很多。

第五、紧跟学科前沿,当前的热点主要有“信号转导”、“细胞周期调控”、 “细胞凋亡”等。细胞生物学是当今发展最快的学科之一,知识的半衰期很短(可能不足5年),国内教科书由于编撰周期较长,一般滞后于学科实际水平5-10年左右,课本中的很多知识都已是陈旧知识。有很多办法可以使你紧跟学科前沿:一是选择国外的最新教材,中国图书进出口公司读者服务部那里可以买到很多价廉物美的正宗原版教材(一般200-400元,只相当于国外价格的1/5);二是经常读一些最新的期刊资料,如果条件所限查不到国外资料,可以到中国期刊网、万方数据等数据库中查一些综述文章,这些文章很多是国家自然科学基金支助的,如在中国期刊网的检索栏输入关键词“细胞凋亡”,二次检索输入关键词“进展”,你会发现一大堆这样的文章,都是汉字写的比读英文省事。

第六、学一点科技史,尤其是生物学史,看看科学家如何开展创造发明,学习他们惊人的毅力、锐敏的眼光和独特的思维。牛顿说过:“我之所以比别人看得更远,是因为站在巨人的肩膀上。”

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细胞生物学(简史)

从研究内容来看细胞生物学的发展可分为三个层次,即:显微水平、超微水平和分子水平。从时间纵轴来看细胞生物学的历史大致可以划分为四个主要的阶段:

第一阶段:从16世纪末—19世纪30年代,是细胞发现和细胞知识的积累阶段。

第二阶段:从19世纪30—20世纪中期,细胞学说形成后,主要进行细胞显微形态的研究。

第三阶段:从20世纪30年代—70年代,以细胞超微结构、核型、带型研究为主要内容。

第四阶段:从20世纪80年代分子克隆技术的成熟到当前,细胞生物学与分子生物学的结合愈来愈紧密,基因调控、信号转导、细胞分化和凋亡、肿瘤生物学等领域成为当前的主流研究内容。


一、显微镜的发明与细胞的发现

没有显微镜就不可能有细胞学诞生。

1.1590 荷兰眼镜制造商J.Janssen和Z.Janssen父子制作了第一台复式显微镜,尽管其放大倍数不超过10倍,但具有划时代的意义。

2.1665 英国人Robert Hook用自己设计与制造的显微镜(放大倍数为40-140倍,图1-1)观察了软木(栎树皮)的薄片,第一次描述了植物细胞的构造,并首次用拉丁文 cella(小室)这个词来称呼他所看到的类似蜂巢的极小的封闭状小室(实际上只是观察到到纤维质的细胞壁)。

3.1672,1682英国人Nehemaih Grew出版了两卷植物显微图谱,注意到了植物细胞中细胞壁与细胞质的区别。

4.1680 荷兰人A. van Leeuwenhoek成为皇家学会会员,一生中制作了200多台显微镜和500多个镜头(图1-2)。他是第一个看到活细胞的人,观察过原生动物、人类精子、鲑鱼的红细胞、牙垢中的细菌等等。

5.1752 英国望远镜商人J. Dollond 发明消色差显微镜。
robert_hook.jpg
图1-1 Robert Hook和他的显微镜
vanLeeuwenhoek.jpg
图1-2 A. van Leeuwenhoek的显微镜(图片来自http://www.arsmachina.com)

6.1812 苏格兰人D. Brewster 发明油浸物镜,并改进了体视显微镜。

7.1886 德国人Ernst Abbe 发明复消差显微镜,并改进了油浸物镜,至此普通光学显微镜技术基本成熟。

8.1932 德国人M. Knoll和E. A. F. Ruska描述了一台最初的电子显微镜,1940年美国和德国制造出分辨力为0.2nm的商品电镜。

9.1932 荷兰籍德国人F. Zernike成功设计了相差显微镜(phasecontrast microscope) ,并因此获1953年诺贝尔物理奖。

10.1981瑞士人G. Binnig和H. RoherI在BM苏黎世实验中心(Zurich Research Center)发明了扫描隧道显微镜而与电镜发明者Ruska同获1986年度的诺贝尔物理学奖。


二、细胞学说

在十九世纪以前许多学者的工作都着眼于细胞的显微结构方面,从事形态上的描述,而对各种有机体中出现细胞的意义一直没有作出理论的概括,直到19世纪30 年代德国人施莱登Matthias Jacob Schleiden 、施旺Theodar Schwann提出:一切植物、动物都是由细胞组成的,细胞是一切动植物的基本单位。这一学说即“细胞学说(Cell Theory)”,在19世纪已有不少科学家的工作对细胞学说的创立做出了很大的贡献,如:

1. Jean-Baptiste de Lamark (1744~1829),获得性遗传理论的创始人,法国退伍陆军中尉,50岁成为巴黎动物学教授,1909年他认为只有具有细胞的机体,才有生命。“It has been recognized for a long time that the membranes which form the envelopes of the brain,of the nerves,of vessels,of all kinds of glands,of viscera,of muscles and their fibers,and even the skin of the body are in general the productions of cellular tissue。 But no one,so far as I know, has yet perceived that cellular tissue is the general matrix of all organization and that without this tissue no living body would be able to exist,nor could it have been formed。”

2. Charles Brisseau Milbel(1776~1854),法国植物学家,1802年认为植物的每一部分都有细胞存在,“the plant is wholly formed of a continuous cellular membranous tissue。Plants are made up of cells,all parts of which are in continuity and form one and the same membranous tissue。”。

3. Henri Dutrochet (1776~1847),法国生理学家,1824年进一步描述了细胞的原理,他认为 “All organic tissues are actually globular cells of exceeding smallness,which appear to be united only by simple adhesive forces; thus all tissues, all animal (and plant) organs, are actually only a cellular tissue variously modified。This uniformity of finer structure proves that organs actually differ among themselves merely in the nature of the substances contained in the vesicular cells of which they are composed” 。

4. Matthias Jacob Schleiden(1804~1881),德国植物学教授[1],1938年发表“植物发生论”(Beiträge zur Phytogenesis),认为无论怎样复杂的植物都有形形色色的细胞构成。他认识到了Brown发现细胞核的重要意义,这一点Brown本人并未做到,他试图重建细胞发育的过程,为此他聪明地选择了胚胎细胞作为他研究的起点,他还在细胞中发现了核仁。

5. Theodor Schwann(1810~1882),德国解剖学教授,一开始就研究Schleiden的细胞形成学说,他完全接受了这个学说,并把它扩展为所有生命现象的起源和基础的一般理论。他把Schleiden在植物中的发现应用到动物中去,并于1838年提出了“细胞学说”(Cell Theory)这个术语;1939年发表了“关于动植物结构和生长一致性的显微研究”(Mikroskopische Untersuchungen über die Übereinstimmung in der Struktur und dem Wachstum der Tiere und Pflanzen)。因此细胞学说的创立被认为归功于Schleiden和Sehwann两个人,而且年份也被定到1839年。

Schwann提出:

1) 有机体是由细胞构成的;

2) 细胞是构成有机体的基本单位。

1855 德国人R. Virchow 提出“一切细胞来源于细胞”(omnis cellula e cellula)的著名论断,进一步完善了细胞学说。

把细胞作为生命的一般单位,以及作为动植物界生命现象的共同基础的这种概念立即受到了普遍的接受。恩格斯将细胞学说誉为19世纪的三大发现之一。


三、细胞生物学的发展

19世纪后期显微技术的改进,生物固定技术(如:Fleming 1882,1884;Canoy 1886)和染色技术的出现极大的方便了人们对细胞显微结构的认识,各种细胞器相继被发现,20世纪30年代电子显微镜技术的问世,是细胞形态的研究达到了空前的高潮。20世纪50年代分子生物学的兴起,推动细胞生物学的研究进入了分子水平。

1. 1831 英国人Robert Brown 发现植物细胞核。

2. 1832 德国人?C. J. Dumortier 观察了藻类的细胞分裂,并认为细胞来源于原来存在的细胞。

3. 1835 德国人H. von Molh 仔细观察了植物的细胞分裂,认为是植物的根和芽尖极易观察到的现象。

4. 1835 法国人F. Dujardin 观察动物活细胞时发现“肉样质”(Sarcode)。

5. 1839 捷克人J. E. Pukinye 用protoplasm这一术语描述细胞物质,“Protoplast”为神学用语,指人类始祖亚当。

6. 1841 波兰人R. Remak发现鸡胚血细胞的直接分裂(无丝分裂)。

7. 1846 德国人H. von Mohl研究了植物原生质,发表了“identifies protoplasm as the substance of cells”。

8. 1848 德国人W. Hofmeister 描绘了鸭跖草Tradescantia的花粉母细胞,明确的体现出染色体,但他没有认识到之一重要性,40年后德国人H. von Waldeyer因这一结构可被碱性染料着色而定名为Chromosome。

9. 1861 德国人M. Shultze 认为动物细胞内的肉样质和植物体内的原生质具有同样的意义。他给细胞的定义是:“the cell is an accumulation of living substance or protoplasm definitely delimited in space and possessing a cell membrane and nucleus。”

10. 1864 德国人Max Schultze 观察了植物的胞间连丝。

11. 1865 德国人J. von Suchs 发现叶绿体。

12. 1866 奥地利人G. Mendel 发表了对豌豆的杂交试验结果,提出遗传的分离规律和自由组合规律。

13. 1868 英国人T. H. Huxley 在爱丁堡作题为“生命的物质基础”(the physical basis of life)的演讲报告时首次把原生质的概念介绍给了英国公众。

14. 1869 瑞士人F. Miescher 从脓细胞中分离出核酸。

15. 1876 德国人O.Hertwig发现海胆的受精现象,其论文题目为“observe the fertilization of a sea urchin egg”。

16. 1879 德国人W. Flemming观察了蝾螈细胞的有丝分裂,于1882年提出了mitosis 这一术语。后来德国人E. Strasburger(1876~80)在植物细胞中发现有丝分裂,认为有丝分裂的实质是核内丝状物(染色体)的形成及其向两个子细胞的平均分配,动植物的受精实质上是父本和母本配子核的融合,并于1984提出了Prophase和Metaphase的概念。

17. 1882 德国人E. Strasburger 提出细胞质(cytoplasm)和核质(nucleoplasm)的概念。

18. 1883 比利时人E. van Beneden 证明马蛔虫Ascaris megalocephala配子的染色体数目是体细胞的一半,并且在受精过程中卵子和精子贡献给合子的染色体数目相等。

19. 1883 比利时人E. van Beneden和德国人T. Boveri发现中心体。

20. 1884 德国人O.Hertwig和E. Strasburger提出细胞核控制遗传的论断。

21. 1886 德国人A. Weismann 提出种质论。

22. 1890 德国人Richard Altmann 描述了线粒体的染色方法,他推测线粒体就像细胞的内共生物,并认为线粒体与能量代谢有关。他还于1889年提出了核酸的概念。

23. 1892 德国人T. Boveri和O. Hertwig研究了减数分裂的本质,并描述了染色体联会现象。

24. 1898 意大利人C. Golgi 用银染法观察高尔基体。

25. 1900 孟德尔在34年前发表的遗传法则被重新发现。

26. 1905 美国人Clarence McClung shows that female mammals have 2 X chromosomes and that males have an X and a Y

27. 1908 美国人T. H. Morgan以Drosophila melanogaster为材料开始著名的遗传学实验,1910年提出遗传的染色体理论,1919年发表“遗传的本质”(Physical Basis of Heredity)。1926年发表“基因学说”(The Theory of the Gene)

28. 1910 德国人A. Kossel获得诺贝尔生理医学奖,他首先分离出腺嘌呤、胸腺嘧啶和组氨酸。

29. 1935 美国人W. M. Stanley 首次得到烟草花叶病毒的结晶体。

30. 1940 德国人G. A. Kausche和H. Ruska 发表了世界第一张叶绿体的电镜照片。

31. 1941 美国人G. W. Beadle和E. L. Tatum提出一个基因一个酶的概念。

32. 1944 美国人O. Avery,C. Macleod 和M. McCarthy等人通过微生物转化试验证明DNA是遗传物质。

33. 1945 美国的K. R. Porter、A. Claude 和 E. F. Fullam发现小鼠成纤维细胞中的内质网。

34. 1949 加拿大人M. Bar发现巴氏小体。

35. 1951 美国人James Bonner发现线粒体与细胞呼吸有关。

36. 1953 美国人J. D. Watson 和英国人F. H. C. Crick提出DNA双螺旋模型。

37. 1955 比利时人C. de Duve发现溶酶体和过氧化物酶体。

38. 1955 美国人Vincent Du Vigneaud因人工合成多肽而获诺贝尔奖

39. 1956年,蒋有兴(美籍华人)利用徐道觉发明的低渗处理技术证实了人的2n为46条,而不是48条。

40. 1957 J. D. Robertson[2]用超薄切片技术获得了清晰的细胞膜照片,显示暗-明-暗三层结构。

41. 1961 英国人P. Mitchell 提出线粒体氧化磷酸化偶联的化学渗透学说,获1978年诺贝尔化学奖。

42. 1961~64 美国人M. W. Nirenberg破译DNA遗传密码。

43. 1968 瑞士人Werner Arber从细菌中发现DNA限制性内切酶。

44. 1970 美国人D. Baltimore、R. Dulbecco 和H. Temin由于发现在RNA肿瘤病毒中存在以RNA为模板,逆转录生成DNA的逆转录酶而获1975共享诺贝尔生理医学奖。

45. 1971 美国人Daniel Nathans 和Hamilton Smith发展了核酸酶切技术。

46. 1973 美国人S. Cohen和H. Boyer将外源基因拼接在质粒中,并在大肠杆菌中表达,从而揭开基因工程的序幕。

47. 1975 英国人F. Sanger设计出DNA测序的双脱氧法。于1980年获诺贝尔化学奖。此外Sanger还由于1953年测定了牛胰岛素的一级结构而获得1958年诺贝尔化学奖。

48. 1982 美国人S. B. Prusiner发现蛋白质因子Prion,更新了医学感染的概念,于1997年获诺贝尔生理医学奖。

49. 1983 美国人K. B. Mullis发明PCR仪,1987年发表了 “Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction”,于1993年获诺贝尔化学奖。

50. 1984 德国人G. J. F. Kohler、阿根廷人C. Milstein[3]和丹麦科学家N. K. Jerne由于发展了单克隆抗体技术,完善了极微量蛋白质的检测技术而分享了诺贝尔生理医学奖。

51. 1989 美国人S. Altman和T. R. Cech由于发现某些RNA具有酶的功能(称为核酶)而共享诺贝尔化学奖。Bishop和Varmus由于发现正常细胞同样带有原癌基因而分享当年的诺贝尔生理医学奖。

52. 1997 多利羊在卢斯林研究所诞生,成为世纪末的重大新闻。多利是Ian Wilmut领导的研究小组克隆的(图1-3)。
doly.jpg
图1-3 多利和邦妮(图片来自http://www.ri.bbsrc.ac.uk)

53. 1998 美国人T. Wakayama和R. Yanagimachi成功地用冻干精子繁殖出小鼠。

54. 2000 世界首例克隆猪在苏格兰诞生,是由Alan Coleman领导的研究小组克隆的。

55. 2001 美国人Leland Hartwell、英国人Paul Nurse、Timothy Hunt因对细胞周期调控机理的研究而获诺贝尔生理医学奖。

56. 2002 英国人Sydney Brenner、美国人H. Robert Horvitz和英国人John E. Sulston,因在器官发育的遗传调控和细胞程序性死亡方面的研究获诺贝尔诺贝尔生理学或医学奖。

57. 2003 美国科学家Peter Agre和Roderick MacKinnon,分别因对细胞膜水通道,离子通道结构和机理研究而获诺贝尔化学奖。


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[1]德国植物学教授,性格暴躁、反复无常。原在Heiderberg学法律,后来在Hamberg当律师,因工作不顺利自杀而未遂。枪伤痊愈后在哥廷根大学和柏林大学研究植物学和医学,获博士学位

[2] 1957. New observations on the ultrastructure of the membranes of frog peripheral nerve fibers. J. Biophys. Biochem. Cytol. 3:1043-1047.

1959 The ultrastructure of cell membranes and their derivatives. Biochem. Soc. Symp. 16: 3-43

[3] 出生于阿根廷,具有英国和阿根廷国籍,在美国获奖。

由 sen 发表于 10:42 AM | 回复 (0)

细胞生物学(前言)

作者:佚名

 细胞是生命的基本单位,细胞的特殊性决定了个体的特殊性,因此,对细胞的深入研究是揭开生命奥秘、改造生命和征服疾病的关键。细胞生物学已经成为当代生物科学中发展最快的一门尖端学科,是生物、农学、医学、畜牧、水产和许多生物相关专业的一门必修课程。50年代以来诺贝尔生理与医学奖大都授予了从事细胞生物学研究的科学家。

  细胞生物学是研究细胞结构、功能及生活史的一门科学。细胞生物学由Cytology发展而来,Cytology是关于细胞形态(特别是染色体) 的研究。现代细胞生物学从显微水平,超微水平和分子水平等不同层次研究细胞的结构、功能及生命活动。在我国基础学科发展规划中,细胞生物学与分子生物学,神经生物学和生态学并列为生命科学的四大基础学科。

  我们衷心地希望这本电子教程能为您的学习和工作带来帮助,也希望您给予宝贵的意见和建议,使我们不断地改进和提高教学水平。

由 sen 发表于 10:23 AM | 回复 (1)

September 27, 2005

这本书就是我们要超越的那本……

本书来自LFS官方网站,是自己编译 LFS 必看书目。

LFS-BOOK Edition 6.1

由 sen 发表于 10:19 AM | 回复 (0)

用slackware引用simsun字体小结

方法一

1、在“/etc/profile.d/lang.sh”中找“export LANG=*****”
把变量LANG的值改为zh_CN,即把整句改成“export LANG=zh_CN”

2、从windows拷贝字体simsun.ttc到/usr/X11R6/lib/X11/fonts/TTF/下

3、修改/etc/X11/xorg.conf,在字体section的地方加上字体路径

… … … …
FontPath ''/usr/X11R6/lib/X11/fonts/cyrillc/
FontPath ''/usr/X11R6/lib/X11/fonts/TTF/ ---------就是加上这一句啦^_^
… … … …

4、更新一下字体啦,用一下命令:
fc-cache -vf

5、reboot 系统,出来就可以啦,可以用locale命令看看是不是有zh_CN.

备注:这种方法出来的中文可以显示,没有粗体,比较粗糟。


方法二:

1、拷贝simsun.ttc到随便一个目录,假设如 "/home/fonts/"

2、修改“/etc/fonts/fonts.conf ”
在此文件中找到 “

/usr/share/fonts”, 在此句前面加上 “/home/fonts

3、修改/etc/X11/xorg.conf
在 “FontPath "/usr/X11R6/lib/X11/fonts/local/" ” 前面加上一句 “FontPath "/home/fonts" ”

4、在用户目录下建立 .bashrc 文件或者 .profile文件(有的.bashrc不管用,就要用.profile)
文件内容:
export LANG=zh_CN.UTF-8
(如果想使用fcitx,就再加上两行:
export LC_CTYPE="zh_CN"
export XMODIFIERS="@im=fcitx" )

5、使用粗体汉字,下载一下三个包:
fontconfig
freetype
libXft

使用以下命令安装:
installpkg *tgz ————此命令限于slackware,其他版本要解压安装

重起一下,就好了

备注:此方法出来效果很好,同时安装的方法很值得其他版本linux借鉴。slackware linux是商业化最早的,系统结构比较传统,大家有机会给它捧捧场。^_^


btw: 用fcitx的话,可以用它的预编译包,不用rpm或者tar.gz包,可以很快搞定,只要XMODIFIERS变量设定了(上文)就可以。

由 sen 发表于 10:08 AM | 回复 (0)

September 23, 2005

2005年暑假蒙古行

dream.jpg
人生的理想:农家,孩子,吃都吃不完的玉米梆子……

selling.JPG
我就是这样卖过来的……

hat.JPG
还有装cool,携村姑出游的时候……

由 sen 发表于 11:00 AM | 回复 (3)

超越构建Linux(序)

前言(原书)

Having helped out with Linux From Scratch for a short time, I noticed that we were getting many queries as to how to do things beyond the base LFS system. At the time, the only assistance specifically offered relating to LFS were the LFS hints (http://www.linuxfromscratch.org/hints). Most of the LFS hints are extremely good and well written but I (and others) could still see a need for more comprehensive help to go Beyond LFS - hence BLFS.

BLFS aims to be more than the LFS-hints converted to XML although much of our work is based around the hints and indeed some authors write both hints and the relevant BLFS sections. We hope that we can provide you with enough information to not only manage to build your system up to what you want, whether it be a web server or a multimedia desktop system, but also that you will learn a lot about system configuration as you go.

Thanks as ever go to everyone in the LFS/BLFS community; especially those who have contributed instructions, written text, answered questions and generally shouted when things were wrong!

Finally, we encourage you to become involved in the community; ask questions on the mailing list or news gateway and join in the fun on #lfs at irc.linuxfromscratch.org. You can find more details about all of these in the Introduction section of the book.

Enjoy using BLFS.

Mark Hymers
markh linuxfromscratch.org
BLFS Editor (July 2001 - March 2003)

I still remember how I found the BLFS project and started using the instructions that were completed at the time. I could not believe how wonderful it was to get an application up and running very quickly, with explanations as to why things were done a certain way. Unfortunately, for me, it wasn't long before I was opening applications that had nothing more than "To be done" on the page. I did what most would do, I waited for someone else to do it. It wasn't too long before I am looking through Bugzilla for something easy to do. As with any learning experience, the definition of what was easy kept changing.

We still encourage you to become involved as BLFS is never really finished. Contributing or just using, we hope you enjoy your BLFS experience.

Larry Lawrence
larry linuxfromscratch.org
BLFS Editor (March 2003 - present)

(哥们,辛苦啦!!)


谁应该读本书

本书主要旨在帮助已经根据LFS书目建立起Linux系统的人。同时,本书对使用其他Linux版本但想构建使用应用软件的用户也很有帮助。本书可以帮助你构建形式多变的Linux系统,所以它的目标读者应该像LFS书目那样广。如果你喜欢Linux系统DIY,那么,你应该会喜欢本书。

自从本书英文版5.0开始已经与LFS书目所匹配,它同LFS书目的以前版本可能有些出入,同时也不能保证它跟以后的LFS版本相类同。

本书结构:

本书分为以下几个部分:

一、介绍

主要介绍本书其他部分的主要内容。

二、LFS后续配置以及额外软件

介绍系统基本配置合基本安全性。同时将介绍一些编辑器,文件系统和LFS书目中所忽略的几种Shell。

三、基本库和附件

该部分将涵盖该书其他部分以及系统附件用到的库文件。编程(包括怎样编译GCC使其支持其他大部分语言)的有用信息也包含在这个部分中。

四、连接网络

介绍不是简单使用静态IP的网络连接方法。

五、基本网络

网络文件和命令行网络命令介绍和使用

六、网络服务器

介绍构建邮件及其他(如 SSH、CVS等)网络服务

七、数据服务

介绍数据库和网络服务软件

八、X-Windows管理

解释如何构建基本X-Windows系统连带一些普通库文件和窗口管理器。

九、KDE

介绍 K Desktop Environment 各个部分

十、GNOME

GNOME 和 KDE 是桌面环境两个有力竞争者,主要介绍GNOME-1.4 和 GNOME-2.6

十一、X 软件

Office办公软件、图形网络浏览器以及其他 X 软件介绍和使用

十二、多媒体

介绍如何配置系统多媒体库文件和安装声频、视频以及CD刻录软件

十三、打印、扫描和排版设置

介绍内容有Ghostscript、CUPS、DocBook 以及安装 TeX

附录

主要包含不是本书内容的信息,可以作为一个索引使用

由 sen 发表于 10:27 AM | 回复 (1)

超越构架Linux(眉面)

Beyond Linux From Scratch
Version 5.1

中文:超越构架Linux

BLFS Development Team

Copyright © 2001-2004 BLFS Development Team

2004-06-05

English Edition Revision History
Revision 5.1 2004-6-05
Third release
Revision 5.0 2003-11-06
Second release
Revision 1.0 2003-04-25
First release

中文版:慢慢翻译^_^


摘要:

本书主要依据《从零构架Linux系统》所成。它将引导读者构架基本Linux系统,并向系统添加网络、X 界面、多媒体支持以及打印扫描支持。

适合读者:初、中、高

致谢:

本书献给世界上所有LFS(Linux From Scratch)爱好者、Nkbbs Linux爱好者、Nkstars所有工作人员^_^

由 sen 发表于 09:34 AM | 回复 (0)

September 20, 2005

剥开乙肝病毒

by 珊瑚


如果你吃下一颗糖,它最终会在肝脏中分解、储存。如果你吃下一片药,它的三分毒性也会在肝脏中得到释放。肝脏是人体新陈代谢的中心,也是最大的“化工厂”。它是人类维持生命活动必不可少的重要器官,也是我们健康的基础。

乙肝是乙型病毒性肝炎,历数现在已知的甲、乙、丙、丁、戊、己、庚七种病毒性肝炎的“罪状”,除了上个世纪80年代猖狂一时的甲肝大爆发,乙肝终于以其持久的耐力、顽强的难愈性力拔头筹,令公众“谈肝色变”。全世界目前大约有4亿乙肝病毒携带者,但是事实上,仅中国就有超过45%,也就是将近7亿人曾经感染乙肝病毒。他们中的绝大多数依靠自身的抵抗力成功的防御了病毒的入侵,而免疫系统出现问题的人们却随着病毒的各种状态与各种“乙肝名词”联系到一起。乙肝,已经成为一个危害人类健康的全球性问题。


  一切从病毒开始

  乙肝病毒(HBV)是一种DNA病毒,就像毒蛇分泌的某种毒液只会针对特定的身体部位起作用一样,乙肝病毒也只对肝脏“情有独衷”,在生物学上它是嗜肝DNA病毒科(hepadnavividae)家族中的一员。这个家族中的病毒成员在哺乳动物和鸟类的身上也都有发现,它们的结构、基因序列和复制策略都非常相似,但是它们之间却不会互相交叉。除了对具体的器官具有特异性,它们对寄主也同样有“种族要求”,比如HBV就只对人和猩猩有易感性。


HBVstructure.jpg
乙肝病毒(HBV)结构示意图


  一个完整的乙肝病毒颗粒,也叫Dane颗粒,直径只有42纳米,大约是一个普通鸡蛋的百万分之一。乙肝病毒有外壳和核心两个部分,也就是说除了绝大多数病毒都具有的美丽“衣壳”外,乙肝病毒还要再加上一件精密的“外套”。外壳就是这件所谓的“外套”,它厚7-8纳米,由脂质双层和蛋白质组成的囊膜。脂质双层内含有S抗原、前S1和前S2抗原,它们一起又构成了外壳上大、中、小三种蛋白形式,统称为乙肝表面抗原(HbsAg),也就是人们俗称的澳抗。关于澳抗的由来还有一段故事,它最早是从澳大利亚土著人血清中分离出来的,当时以为是当地民族特有的一个遗传标志,所以称之为“澳大利亚抗原”。到后来才知道就是乙肝病毒表面抗原。所谓抗原其实就是会引起机体抵抗反应的元素,而与之相对的,机体中可以识别并抵抗抗原的元素就是抗体了。

  剥去Dano颗粒的外壳,暴露出乙肝病毒的核心颗粒。核心颗粒直径28纳米,呈二十面体立体对称,它的表面才是病毒真正的衣壳,由乙肝病毒的核心抗原(HBcAg)组成。游离态的核衣壳只能在肝细胞的细胞核内观察到。通过强去垢剂或者酶处理的方法,还可以暴露出HBV的另一个主要的抗原e抗原,它的本质还不是十分清楚,但多数人认为是核心的断片。

  Dano颗粒的中心部位就是环状并且有缺口的DNA双链,和依附在上面的DNA聚合酶。乙肝病毒的基因组最引人注目的一个特征就是它非常小,其DNA分子大约含有约3200个核苷酸,比已知的最大的病毒基因组小几百倍,和人类拥有的基因组相比较,仅仅是百万分之一。而且乙肝病毒DNA的两链长短不一,长链完整,长度恒定,为负链。短链是正链,长度可变,大概是长链的50%~80%。表面抗原和核心抗原都是由Dane颗粒的DNA编码而来。


HBV3Status.jpg
电子显微镜下可以观察到乙肝病毒3种不同的形态:大球形颗粒,小球形颗粒和管形颗粒


现实中,在电子显微镜下可以观察到乙肝病毒3种不同的形态:大球形颗粒、小球形颗粒和管形颗粒。大球形颗粒就是Dano颗粒。小形球颗粒,直径大约22纳米,是乙肝病毒感染后血液中最多见的一种。它由表面抗原组成,并不含有乙肝病毒的DNA以及DNA聚合酶。管形颗粒,直径也约为22纳米,长度在50~70纳米之间。实际上是由几个小球形颗粒聚合在一起而成,但同样具有HBsAg的抗原性。不管是小球还是管形颗粒都不是完整的乙肝病毒颗粒,它们是乙肝病毒在感染肝细胞时合成过剩的囊膜,游离在人体的血循环中。


  DNA的竞争

  不同于一个真正的生物体,病毒并不通过生长和分裂等方式繁殖自身,而是像我们铸造机器零件一样,按照一定的模具拷贝出来的。病毒DNA中包含有一些程序,指导病毒的遗传物质和其它一些结构蛋白组分增殖。另外,病毒DNA中还包含有一些信息,使得单一组分能够在细胞因子的帮助下,自发组装成新的病毒颗粒。

  在医学上,病毒的繁殖被称之为“复制”,在复制的过程中,有两个很重要的因素:一个是催化剂,另一个是模板。没有这两个因素,乙肝病毒就不能复制。乙肝病毒复制的“催化剂”就是乙肝病毒DNA 聚合酶。没有这种聚合酶的作用,乙肝病毒的复制就会停止。

  乙肝病毒的基因组(DNA )是由两条螺旋的DNA 链围成的一个环形结构。其中一条较长负链已经形成完整的环状;另一条长度较短的正链,呈半环状。在感染肝细胞之后,这条半环状的DNA 链就会以负链为模板,在催化剂──乙肝病毒DNA 聚合酶的作用下延长,最终形成完整的环状。这时的乙肝病毒基因组就形成了一个完全环状的双股DNA.我们把这种DNA 称做共价闭合环状DNA (即cccDNA),可以把它看作是病毒复制的原始模板。模板形成后,病毒基因会以其中的一条cccDNA为模板,利用肝细胞基因中的酶和DNA 聚合酶的“催化”,一段基因又一段基因地复制,形成负链和正链。最后再装配到一起形成新的乙肝病毒DNA 颗粒。


HBVreplicating.jpg
乙肝病毒复制效果图


这种cccDNA是乙肝病毒复制中重要的中间产物,一旦它在肝细胞核内形成,就具有了高度的稳定性,可长期存在于肝细胞内,不但起着刚才所说的" 模板" 作用,而且还像深深扎根在泥土里的野草一样很难完全清除。不论用什么抗病毒药物,不论细胞内的DNA 受到多大的抑制,也不论用药的时间有多久,都很难清除这种cccDNA. 只要肝细胞内有很少量的cccDNA,当停药后,核内的cccDNA又可以再次成为病毒复制的“模型”,继续复制乙肝病毒的DNA,这也是乙肝很难根治的原因。

   现实生活中,大部分人熟悉的“乙肝两对半”检测的其实并非乙肝病毒的传染物质和致病物(换句话说,不是活的乙肝病毒),所以检查“乙肝两对半”只能反映一个人是否感染过乙肝,却不能直接深入地揭示乙肝病毒在人体内的复制和致病情况,也就不能更好地指导临床用药和制订治疗方案。为了寻找到一个正确合理的病毒量化指标,专家们经过多年研究,找到了一个有效的办法──乙肝病毒DNA定量试验。这种试验可以反映患者血中活的病毒量,有助于了解乙肝病毒在患者体内的消长。乙肝病毒DNA是含有遗传信息的物质,它是复制子代乙肝病毒的基础。因此,了解了乙肝病毒DNA在患者体内的消长情况,就间接地弄清了乙肝病毒的复制情况。

  其实乙肝病毒本身并不致病,它对肝细胞损伤主要是由机体的免疫系统清除反应引起的。乙肝病毒感染机体后,侵入到肝细胞内,致使肝细胞的某些结构发生变化。激发机体对自身的肝细胞产生免疫反应,便会引起会细胞损伤。在严重的肝损害病例中,机体免疫系统甚至将没有被HBV侵犯的肝细胞也一同杀死,这也说明自身免疫反应在乙肝炎的发病机制中有重要意义。免疫功能正常者,机体对感染HBV的肝细胞发生一系列的免疫反应,随着病毒被逐步消除,逐渐痊愈。这正是我国有45%以上的人曾经感染过乙肝病毒,但最终大部分人体内已经没有乙肝病毒残留的原因。

  尽管在过去的数百万年里,人类在进化过程中逐渐从病毒那里获取了上百种的基因,但是当一个新的病毒入侵机体的时候,正常工作的强大的免疫系统还是不能容忍病毒DNA对细胞资源的侵占,会毫不犹豫的努力清洗“入侵者”。


  在病毒中尚未结束

  病毒复制快变异快,和身体细胞关系密切,甚至有可能跟细胞的DNA结合在一起,终生相伴,普通针对病毒的药物很难不伤害到细胞,这些都是治疗病毒时面临的很大的困难。直到现在,国内外还没有根治乙肝的有效方法。

  一旦自身免疫系统无法阻击病毒的入侵,那么把握住病毒的规律,抗病毒治疗仍然有章可循,从病毒的特点入手禁止病毒入内,卡住病毒的复制,阻止病毒蛋白质的产生,遏制病毒的逃逸途径,以及避免病毒的抗药性等方面许多科学研究都在展开。

  目前国际公认比较好的、临床应用最成功和最广泛的是干扰素治疗和核苷类似物的拉米夫定疗法,但有这两种疗法有严格的适用状况,而且用药时间长、完全治愈的可能性很低,只能有一部分人达到大三阳转小三阳、DNA转阴这样的清除血内病毒的作用,而且有一定副作用。拉米夫定可能导致病毒变异,从而使拉米夫定失效。这两种药停药不慎的话可能有激烈的病情反弹。所以科学家们正在积极的寻求它们的姊妹药物,一些已经进入三期临床试验。2004年10月29日至11月2日在波士顿召开的国际肝脏病学年会以较多的篇幅对病毒性肝炎抗病毒治疗进行了报道,一改过去对肝炎治疗较为沉闷的局面,抗病毒治疗的涉及面广,杂色纷呈。由于目前抗HBV的药物疗效有限,很多学者都认为今后的发展方向为联合治疗,这也是今后研究的重点。

  针对治疗性乙肝疫苗的研制,我国复旦大学闻玉梅院士领导的研究组,重庆佳辰公司以及浙江大学三支队伍都做了大量的工作。目前也已经进入临床验证阶段。

  除了治疗性工作的开展,预防其实对于整个社会和个人来说或许更应该收到重视,毕竟建立在健康基础上的防患于未然才是目前针对乙肝最行之有效的办法。我国普遍接种的预防性疫苗对乙肝病毒有非常好的预防效果。健康人在接种疫苗后,体内绝大多数会产生出乙肝病毒的保护性抗体,就不会再感染乙型肝炎。乙肝病毒携带者所生的婴儿,只要在出生第一天注射乙肝疫苗,以后再逐步进行巩固性接种,一般可以杜绝乙肝病毒的感染。所以预防性乙肝疫苗已经成为新生婴儿的常规性疫苗。我国最新研制出来的甲乙肝联苗,通过临床验证,不仅可以有效提高免疫应答,具有同时注射单支甲肝疫苗、乙肝疫苗同样的效果,而且有助于减少射次数和漏种率。此前,只有美国成功将甲、乙肝疫苗联合接种使用。它的使用将进一步有利于甲乙肝防治工作的开展。

  在过去的30年中,对肝炎病毒的发现和研究,以及血液筛查和疫苗的使用,使科学家坚信病毒性肝炎将很快被人类所控制,它将永远不会象过去的几千年那样对人类造成威协。


小知识:乙肝两对半

  通过检测乙肝病毒的抗体可以简单的判断感是否染了乙肝病毒,所以检测澳抗是一项重要的临床诊断指标。但仅仅检测一种抗体还无发完全判断出乙肝病毒目前的状态,最好的办法就是将和乙肝相关的抗原和抗体全部检测出来,这就是:乙肝表面抗原(HBsAg)、e抗原(HBeAg)和核心抗原(HBcAg),以及三种抗原诱生的相应的抗体,分别是表面抗体(抗—HBs)、e抗体(抗—HBe)和核心抗体(抗—HBc)。由于技术的原因,一般实验室无法检验核心抗原,所以三对抗原抗体少了一项,因此医院验乙肝病毒标志是查“乙肝五项”,俗称两对半。

  通常所说的“大三阳”是指乙肝表面抗原、e抗原、核心抗体三项阳性;而“小三阳”指的是是表面抗原、e抗体、核心抗体阳性。各抗原抗体在临床上还有其不同的指示意义:表面抗原(HBsAg)表示体内是否存在乙肝病毒;表面抗体(抗-HBs)表示体内是否有保护性,可以抵抗病毒入侵;е抗原(HBeAg)表示病毒是否复制及具有传染性;е抗体(抗-HBe)则表示病毒复制是否受到抑制;而核心抗体(抗-HBc)主要表示是否感染过乙肝病毒。

由 sen 发表于 09:42 AM | 回复 (0)

September 18, 2005

年年想着拜阿娘

“月怕十五,年怕中秋。”

小时候不懂事,现在记忆也留下一片空白。很多人说,愿意牺牲什么什么,也要换回童年,我却不知道如果真的换回来,还能做什么。日子就是这样过来的吧,用一句让人觉得很没用的话语:顺其自然吧。

老家中秋到的时候,总是要把它当作一件很大的事情。儿童都喜欢中秋,因为中秋有儿童的一部分。潮州人信神,以前说是迷信,现在说是民俗。中秋节夜晚,潮州人喜欢在阳台摆设供台,上香叩拜阿娘。想想阿娘应该指嫦娥,但是没有考证。大人说可以求家人平安。很多有小孩子的潮州父母喜欢在供台上呈放小孩子用的文具,说是这样的文具小孩子用了就会很聪明。最苦天下父母心啊。在潮州生活的孩子很幸福,因为潮州很重教,拜刺史韩愈所赐。

老潮州的中秋节,在我到北方以后,就只能在电话里感受了。母亲那头开心地说很多事情,关切地叮嘱很多事情,我这边有无尽的孤独感。男孩长大都变得很虚伪,不开心都哭不出来。

第一次在天津过中秋,南开校园冷冷清清。那个时候我还住在校外,宿舍空空荡荡。那夜我从南开东门走到西门,手里拿着一张200长途电话卡,不知道给谁打电话。南开现在的路很好了,以前大中路坑坑洼洼,路灯昏暗昏暗,只有那些杨树,过了好几年,一点样子改变都看不出来。

眨眼就过了五年多,想家已经不再象以往那样强烈,给家里打电话开始让人觉得是百忙中的负担。时间是可以挤的,可是最常最常忘记的就是给家里打个电话。妈妈在我大学4年里只给我打了一次电话,其实我知道,每个周末,她都会很刻意的在家等我的电话。妈妈已经有点老了,慢慢长出白发了,慢慢让人看了觉得很心疼。不知道我这个儿子,是让她觉得骄傲,还是让她失望。孤独时,我知道她在想我,失落时,我知道她在想我,伤心时,我知道她在许愿让我活得开心。这个世上,爱过的人很多,被爱也很多,母亲总是在这些感情之外,象一道光,从无上的地方,注入心房。

人大了,人老了,有一种感觉要珍惜,并尽量把它留住。今天开始想家……

由 sen 发表于 12:22 AM | 回复 (0)

September 15, 2005

如果这样做一个开始……

“人心散了,队伍不好带啊!”

不管怎么样,还有几位朋友让人觉得很温暖,比如梭梭,比如os,比如花花。记得以前diveinme说过,我们要的只是一个地方可以跳舞。今天跳舞的地方有了,交流变得困难了。如果能回到过去那段让人觉得艰难,但是大家齐心协力的日子,给我做什么都愿意。南开呆了5年,浑浑噩噩过了三年,流浪了一年,给Ballroom当牛当马又是一年,想说没有感情不简单啊。

记得那个时候,暑假训练结束,大家围围坐说谁愿意进入Ballroom,那个时候还有yapi,还有vansa,还有一个瘦瘦单单的女孩。treeme也是那个时候的,傻傻的孩子,有空就去西南村的停车场上面做平转。觉得yapi那个时候对Ballroom做得最多,开学的时候还是离开了,并三番四次说会回来,但是不可能啦。人有的时候需要一点在我,需要一点尊重,yapi注定会走,就像今天很多人一样。后来Equinox也走了,帮了我很多,让我觉得很对不起他。人人不同,尽心尽力,结果却一样。以前我还豪情壮语头头是道,什么“Ballroom如果让一个团员失望,那就是Ballroom的失败”云云。一个人容易惭愧,证明他还有良心,对已经离去的团员,觉得很惭愧,但是却依然为这样的机制卖身卖命,羞愧!

也许也是我该走的时候了,花花说最重要的开心,道理多么简单,只是自己一直不去做。就做一个Bless的姿态吧,希望它明天会好起来。

由 sen 发表于 04:14 PM | 回复 (1)